Plusieurs protocoles de transfert de données peuvent être implémentée dans le modem lui-même. Ces protocoles complètent ou remplacent avantageusement les protocoles de transfert de fichier de type Xmodem.
Nous citerons ici les protocoles MNP (pour Microcom Networking Protocol) et LAP-M (Link Access Procedure for Modems). Ces protocoles effectuent la détection des erreurs grâce au calcul d'un code à redondance cyclique (CRC). En cas d'apparition d'erreurs, ils gèrent la retransmission des trames erronées. Les protocoles MNP et LAP-M sont spécifiés dans les recommandations V42 et V42bis de l'ITU-T.